本發明公開基于強化學習的蛋白質動態配體通道最優路徑分析方法,包括如下步驟:獲取所述蛋白質的靜態配體通道信息和全原子動態信息,篩選組成通道的部分原子的動態性并引入三維空間下的柵格法和原子碰撞檢測機制,構造仿真環境;構建強化學習模型,所述強化學習模型包括狀態、智能體、動作和獎勵;當配體分子走出三維空間柵格地圖的邊界則給當前狀態一個負的反饋值并返回上一狀態繼續訓練,直至到達通道終點或者達到單輪最大探索步數,則本輪訓練結束,輸出本輪訓練結果;繼續下一輪訓練,直至所有訓練輪次全部結束,輸出蛋白質動態配體通道最優路徑。本發明能夠協助配體分子找到到達催化活性中心位置的最優路徑,具備一定的工程應用參考價值。
聲明:
“基于強化學習的蛋白質動態配體通道最優路徑分析方法” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究,如用于商業用途,請聯系該技術所有人。
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