本發明涉及一種不同生理或病理條件下整體蛋白質的定量分析方法,首先將兩組不同生理或病理條件的整體蛋白分別作為控制組與疾病組,進行還原和烷基化;對兩組烷基化的蛋白序列中賴氨酸殘基上的ε-氨基進行化學保護;將經化學保護后的兩組蛋白質的N端氨基進行同重標記;同重標記后兩組蛋白按等比例混合進行高分辨質譜和串級質譜分析得到一個數據組;對數據組進行定性、定量數據庫搜索,得到蛋白質的ID及疾病組每一個蛋白質相對于控制組的相對比例,即疾病條件下所有蛋白的上調或下調情況。與現有技術相比,本發明方法標記效率高,準確度高,適用于整體蛋白質基于高分辨串級質譜的定量分析。
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