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    氧化葡萄糖酸桿菌的基因組尺度代謝網絡構建和分析方法

    785   編輯：管理員   來源：中冶有色網  
    2023-03-19 06:54:49
    一種氧化葡萄糖酸桿菌的基因組尺度代謝網絡構建和分析方法：利用KEGG數據庫中氧化葡萄糖酸桿菌的基因注釋信息和對應酶的生物化學信息構建反應列表草圖；對草圖進行修改；添加生物量合成、運輸和交換反應形成代謝網絡；將代謝網絡轉化為SBML格式，利用Matlab和COBRA？Toolbox對代謝網絡進行調試，分析存在的缺口和無效循環，并根據調試結果進行修正；根據代謝網絡，利用Pajek繪制代謝網絡圖，并進行網絡拓撲結構分析；根據代謝網絡，利用Matlab和COBRA？Toolbox進行魯棒性、基因必要性和通量可變性分析中的一種或多種分析。本發明分析氧化葡萄糖酸桿菌在生產二羥基丙酮、維生素C和葡萄糖酸等各種產物時的代謝狀態。
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    化學分析
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