本發明提供一種活性蛋白質與小分子相互作用的質譜檢測方法,該方法在保持活性狀態下對蛋白質進行體外共價化學標記,通過蛋白質上特定氨基酸位點在與小分子相互作用前后標記效率的差異情況,判斷小分子與蛋白質相互作用的位點和強度。本發明能對蛋白質抑制劑候選小分子進行高通量篩選和對特定小分子的潛在蛋白質靶點進行規?;b定分析。通過對兒茶酚甲基轉移化酶(Catechol?O?methyltransferase,COMT)?小分子相互作用和復雜體系生物體系中ATP結合蛋白質的規?;b定分析,證明了該方法的準確性和高效性。
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