一種預測小分子CYP代謝酶的代謝位點的方法及系統,包括:收集與代謝位點相關的分子結構數據,基于不同代謝酶亞型將收集的數據整理成為不同亞型的數據集;將二維分子結構轉化為三維分子結構;將分子三維結構中的原子類型的矢量化;將分子三維結構中距離的矢量化;將原子類型的矢量作為圖卷積神經網絡中頂點信息矢量化矩陣,將距離的矢量作為圖卷積神經網絡中邊信息矢量化矩陣,根據圖卷積神經網絡模型更新頂點信息,計算原子為代謝位點的概率;在不同CYP代謝酶亞型上根據為代謝位點的概率預測代謝位點;上述方法及系統,對分子與不同亞型的CYP代謝發生化學反應的代謝位點預測,該預測結果可以幫助藥物化學家設計或者優化分子結構。
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