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    LncRNA和環境因素關聯關系的高效預測方法

    1006   編輯：管理員   來源：中冶有色網  
    2023-03-19 07:29:08
    本發明公開一種LncRNA和環境因素關聯關系的高效預測方法，主要包括以下步驟：1、下載數據集，得到LncRNA和環境因素(EF)的列表，和二者關聯關系的關聯矩陣A；然后分別計算出LncRNA和EF的高斯相互作用屬性核相似矩陣KL、KE。2、計算EF之間的化學結構相似性矩陣E。3、將KL進行邏輯斯蒂函數轉換，得到相似矩陣SL；且利用E和KE構建EF的相似矩陣SE。4、融合A、SL和SE構建一個全局異構網絡G；利用重啟隨機游走計算擴散特征，并使用奇異值分解降維。5、計算lncRNA?EF對的Hetesim得分。6、結合擴散特征和HeteSim得分得到特征數據集并用于訓練梯度提升樹分類器去預測LncRNA?EF的關聯關系。7、使用10折交叉驗證方法對提出的方法進行驗證。應用本發明預測LncRNA和EF關聯關系的精度高。
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    聲明：
    “LncRNA和環境因素關聯關系的高效預測方法” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究，如用于商業用途，請聯系該技術所有人。
    我是此專利(論文)的發明人(作者)
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    化學分析
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