本發明公開了一種同位素標記試劑,是異硫氰酸基嘧啶類同位素標記試劑,其化學名為:[d0]/[d6]-4,6-二甲氧基嘧啶-2-異硫氰酸酯。該試劑的制備是首先將4,6-二氯-2-氨基嘧啶與甲醇鈉/氘代甲醇鈉反應,制得[d0]/[d6]-4,6-二甲氧基-2-氨基嘧啶粗產物;再將所得粗產物與硫光氣和碳酸氫鈉進行回流反應,得到最終粗產品;然后進行柱層析,即得本發明所述的同位素標記試劑。本發明的同位素標記試劑可應用在多肽N端殘基的鑒定分析及蛋白質的定量分析中,可以加快標記反應速率、提高標記肽段的信號、有利于增強鑒定肽段的準確性和可信性;且標記部分的分子量較小,結構相對簡單,性質穩定,具有操作簡便等優點。
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