本發明公開了一種蛋白質無標絕對定量方法,其步驟包括:1)從篩選出的高可信蛋白質中選取出若干肽段作為高可信肽段,計算每一高可信肽段的物理化學性質及肽段定量效率;2)基于高可信肽段的物理化學性質和肽段定量效率,構建訓練集;然后利用該訓練集訓練得到肽段定量效率預測模型;3)利用所述肽段定量效率預測模型預測鑒定蛋白質的各鑒定肽段的肽段定量效率;4)根據鑒定蛋白的各鑒定肽段的原始質譜信號強度和對應肽段定量效率計算該鑒定蛋白質的定量值;5)根據標準蛋白質的已知濃度和定量值預測其他待測蛋白質的蛋白質濃度值。本發明從蛋白層面和肽段層面來考慮對質譜原始信號強度進行校正,從而探索更準確的蛋白質絕對定量方法。
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