本發明涉及一種整體蛋白質定量分析方法,首先將兩組不同生理或病理條件的整體蛋白質分別作為控制組與疾病組,并分別對可能存在的二硫鍵進行還原,同時對巰基進行烷基化保護;然后對兩組烷基化的蛋白質的氨基酸特定官能團進行全同重化學共價標記;同重標記后兩組蛋白質按等比例混合進行高分辨質譜和串級質譜分析得到一個數據組;最后對數據組進行定性、定量數據庫搜索,得到蛋白質的ID及疾病組每一個蛋白質相對于控制組的相對比例,即疾病條件下所有蛋白的上調或下調情況,上調或下調倍數最大的蛋白即為與該疾病發生、發展相關的蛋白。與現有技術相比,本發明方法標記效率高,準確度高,適用于整體蛋白質基于高分辨串級質譜的定量分析。
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