三維結構數據庫檢索對生物高分子配位化合物 的方法, 該方法包括以下的工序, (1)對于2種以上的試驗化合物 的三維坐標給予氫鍵性質編號、分子力場計算用的信息及作成 構象用的信息的第1工序; (2)從生物高分子的三維坐標, 準備配 位體結合區域的物理化學的信息及空位原子的第2工序; (3)對 于第1工序準備的試驗化合物的三維坐標給予氫鍵性質編號、 分子力場計算用的信息及制作構象用的信息、以及以第2工序 準備的配位體結合區域的物理化學的信息為基礎, 在不斷變化 試驗化合物的構象條件下, 使生物高分子和試驗化合物對接作 成復合體的結構, 通過評價生物高分子和試驗化合物分子間的 相互作用探索上述復合體的最穩定的結構的第3工序; (4)根據 第3工序探索的最穩定復合體結構時的生物高分子和試驗化合 物的相互作用能量值, 判斷是否將該試驗化合物選擇為配位候 補化合物的第4工序及(5)對于所有的試驗化合物重復第3工序 及第4工序操作的第5工序。
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