本發明公開了一種基于蛋白質分子場預測相互作用位點的方法,首先搭建起一個GPU與CPU異構的高性能集群計算平臺并建立優化算法以進行蛋白質的復雜生物計算,實現蛋白質相互作用的分子動力學模擬,從蛋白質分子相互作用開始到結束,保存其中若干幀的位置信息,對每一幀計算蛋白質分子場,最后分析蛋白質中每一個殘基的分子場變化,找出變化最大的若干個殘基,即可能的相互作用位點。本發明利用建立的GPU與CPU異構的高性能集群計算平臺及其優化計算途徑,運用量子化學計算蛋白質分子場,具有較高的精度,可以方便、快速、有效地對蛋白質相互作用過程進行分析,對可能的作用位點具有較高的預測度,在生物計算領域具有很大的實用價值。
聲明:
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