本發明提供了在復合體混合物中分離和鑒定參與蛋白質-蛋白質相互作用的蛋白質的方法。該方法使用化學反應性支持基質來分離蛋白質,蛋白質隨后非共價結合其它蛋白質。分離支持基質,隨后將非共價結合的蛋白質釋放用于分析。由于在結合和釋放步驟中都可通過化學操作影響蛋白質,鑒定非共價結合蛋白產生關于特定相互作用蛋白質種類的信息,如鈣依賴或底物依賴性蛋白質相互作用。這允許在特定相互作用標準基礎上從復合體混合物中選擇蛋白質亞群。此方法優勢是能同時篩選完整蛋白質組,不像雙雜交系統或噬菌體展示方法,它們每次僅能檢測結合單一釣餌蛋白。該方法可應用于研究活組織切片和尸體解剖樣本中的蛋白質-蛋白質相互作用,研究信號分子、藥物試劑或毒素存在時的蛋白質-蛋白質相互作用,用于比較患病和正常組織或癌和未轉化細胞。
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