本發明公開了一種基于計算機模擬獲取可調控的TRPV5變異體的方法。所述方法首先采用CHARMM?GUI對通道蛋白質進行變異處理,隨后使用Amber16中的分子動力學模擬模塊pmemd.cuda對不同狀態下的TRPV5通道蛋白變異體陽離子進行模擬,最后結合使用VMD和Amber16中的cpptraj模塊分析陽離子的運動路徑,來驗證該TRPV5通道蛋白變異體的通道性能。本發明可對整個模擬體系的運動軌跡進行研究解析,克服了中間狀態難以連續觀測的難題,并且能夠直觀地觀測到陽離子在極短的時間尺度內的運動變化。整個計算過程效率高,耗時短,操作簡單,有助于在生物化學、蛋白質工程學等領域的廣泛應用。
聲明:
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