本發明公開了一種基于自編碼器的蛋白質降解靶向嵌合體的連接體設計方法,包括以下步驟:將已有的蛋白質降解靶向嵌合體的連接體用分子庫中的各種小分子進行替換,剔除不符合化學規則的替換,得到大量的偽嵌合體分子,將這些偽嵌合體分子按一定的比例劃分為訓練集和驗證集;設計一個連接體設計網絡,在訓練集上訓練,能夠較好地重建出每一個輸入分子的連接體;將在偽嵌合體分子集上訓練好的模型在真實嵌合體分子集上進行微調;將最終訓練好的網絡在測試集上進行驗證,并測試解碼器對于從給定分布得到的隨機采樣的生成效果。
聲明:
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