一個大分子陣列(100)(主陣列),例如通過二維電泳得到的蛋白質,隨后通過電印跡或類似方法轉移到支撐膜(102)。捕捉主陣列的圖像(202),確定在主陣列中的各種大分子點的坐標(402)。該過程的下一個步驟是用皮升(p1)分配器(702)將一種或多種試劑或化學物質的第二(或微)陣列印到主陣列的一個或多個點/坐標上。如果大分子為蛋白質,則試劑可以是酶,例如胰蛋白酶或GluC等。使用兩種不同的酶,將它們沉積到同一個點的不同坐標上,這將在不同的氨基酸位點分開蛋白質,并且當該點在MALDI-TOF質譜儀中分析時,將提供蛋白質中多肽的增加的分布或匹配。
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