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    檢測大腸桿菌λ噬菌體全基因組堿基修飾單倍型的方法

    723   編輯:管理員   來源:中冶有色網  
    2023-03-19 07:06:47
    本發明公開一種檢測大腸桿菌λ噬菌體全基因組堿基修飾單倍型的方法,該方法是先利用SMRT?Portal數據分析平臺,將大腸桿菌λ噬菌體基因組測序數據選擇相應的Protocol協議進行數據分析,然后通過獲得的包含大量堿基修飾信息的文件,利用perl語言編寫代碼找出經化學修飾的堿基完整信息,即包括m4C、m6A和其他堿基修飾的具體位點信息。通過該方法鑒定出的大腸桿菌λ噬菌體基因組中的堿基修飾情況,能夠為在構建λ噬菌體載體中研究限制性酶切割λDNA中的效果,外源DNA連接在λDNA序列中的效率,以及在λ噬菌體基因組中有部分基因的表達與大腸桿菌密切相關等方面進一步的研究,提供更多的實用信息,提高工作效率,具有很大的應用價值。
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